Основой организации являются Ротари Клубы. Каждый Клуб – это самостоятельная общественная организация, действующая согласно законодательства страны расположения в соответствии с Уставом и Правилами Клуба. Ротари Интернэшнл(РИ) – международная ассоциация Ротари Клубов. Клуб под названием Ротари должен быть зарегистрирован в РИ и получить Хартию.
Штаб-квартира Ротари Интернэшнл находится в Эванстоне (США). Координацию работы Клубов в отдельных регионах осуществляют семь региональных офисов. Региональный офис РИ, который обслуживает Клубы Европы, Африки и Восточного Средиземноморья, находится в Цюрихе (Швейцария).
Объединения Ротари Клубов по территориальному принципу называют Дистриктами. В свою очередь, группа Дистриктов образует зону. На сегодня в Ротари 537 Дистриктов объединены в 34 зоны.
Руководство РИ осуществляет Совет Директоров, в который избирается по одному директору от пары зон сроком на два года. Возглавляет Совет Директоров Президент Ротари Интернешнл.
В Ротари все руководящие должности являются выборными и ни одна должность, от Президента Клуба до Президента Ротари Интернешнл, не может заниматься Ротартанцем более одного года. Ротарианский год начинается 1 июля и завершается 30 июня следующего года.